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電泳如何工作



凝膠電泳
,通常也稱為DNA電泳或簡(jiǎn)稱為電泳,是一種根據(jù)大小分離DNA片段(和其他帶電分子)的技術(shù)。通常使用瓊脂糖凝膠和電荷完成此步驟,以使片段彼此分離。

該技術(shù)具有許多應(yīng)用,包括檢查DNA,DNA指紋,犯罪學(xué)以及各種醫(yī)療應(yīng)用。

什么是凝膠電泳?

凝膠電泳是一項(xiàng)技術(shù),可讓科學(xué)家根據(jù)大小分離帶電分子。這包括DNA,RNA和蛋白質(zhì)。

請(qǐng)記住,由于分子的糖-磷酸骨架中帶負(fù)電的氧分子,DNA和RNA帶有輕微的負(fù)電荷。取決于多肽鏈中的氨基酸,蛋白質(zhì)可以具有一定范圍的電荷。

電泳的組成

為了進(jìn)行電泳,首先需要制備凝膠。這幾乎可以在任何實(shí)驗(yàn)室中完成。瓊脂糖凝膠是最常見(jiàn)的。為了制作凝膠,將瓊脂糖粉與一種稱為電泳緩沖液的特殊緩沖液混合。然后加熱該混合物直至瓊脂糖溶解并在緩沖溶液中充分混合。

請(qǐng)注意,某些電泳方案要求添加溴化乙錠(Et-Br)。這會(huì)染色電泳中使用的所有DNA,以使您可以在紫外線下查看片段的位置。

塑造凝膠

然后將其倒入稱為凝膠澆鑄托盤(pán)的矩形模具中。與產(chǎn)生用于電泳的矩形凝膠的模具一起,將梳子置于凝膠的一端。這種梳子可以將您希望通過(guò)電泳分離的樣品裝載到孔中。您可以在這里看到圖片。

凝膠硬化后,將孔梳移開(kāi),并將凝膠放入特殊的電泳槽中。在槽中填充另一種緩沖液,直到有一小層緩沖液完全覆蓋瓊脂糖凝膠。

該罐通過(guò)緩沖溶液,再通過(guò)瓊脂糖凝膠產(chǎn)生電流(范圍為50至150 V)。瓊脂糖凝膠的孔位于電流的負(fù)極(陰極),凝膠的另一端位于電流的正極(陽(yáng)極)。

電泳如何工作?

在電流通過(guò)水箱和凝膠之前,您的樣品已裝入孔中。這是使用微量移液器完成的。“標(biāo)記”樣本(也稱為DNA階梯)是具有已知DNA片段大小的樣本,可以幫助您比較樣本并了解所測(cè)試樣本的大小。

通常,將跟蹤染料(也稱為填充染料)添加到每個(gè)樣品中,以幫助您將樣品加載到孔中。染料還可以幫助您跟蹤樣品在凝膠中的運(yùn)動(dòng)。

那么樣品實(shí)際上如何在凝膠中移動(dòng)并按大小分開(kāi)?它與流過(guò)瓊脂糖凝膠的電流以及片段和瓊脂糖凝膠的大小/結(jié)構(gòu)有關(guān)。

電荷和大小決定DNA條帶

請(qǐng)記住,總體而言,DNA電荷是負(fù)的。因此,當(dāng)將這些樣品放置在靠近電流負(fù)端的孔中時(shí),這將導(dǎo)致帶負(fù)電荷的DNA 從陰極移走(負(fù)電荷),并在相反端移向陽(yáng)極(正電荷) 。

除了樣品的這種移動(dòng)之外,電泳還通過(guò)大小將樣品和這些樣品中的片段分離。這是因?yàn)檩^小的分子和碎片可以更快,更輕松地通過(guò)凝膠,而較大的分子和碎片則移動(dòng)更慢。這意味著小片段將比大片段更快地移至凝膠末端,因此,每個(gè)片段均按大小分開(kāi)。

凝膠運(yùn)行約一個(gè)小時(shí)(在大多數(shù)規(guī)程中)后,關(guān)閉電荷并分析凝膠。您會(huì)在凝膠的各個(gè)點(diǎn)看到一個(gè)明顯的矩形帶,通常稱為DNA帶或蛋白質(zhì)帶。每個(gè)帶代表一個(gè)沿著凝膠移動(dòng)的片段。

電泳儀的應(yīng)用與用途

電泳儀在實(shí)驗(yàn)室中有許多應(yīng)用。這里僅僅是少數(shù):

  • 用于犯罪現(xiàn)場(chǎng)和基因檢測(cè)的 DNA指紋
  • 測(cè)試聚合酶鏈反應(yīng)產(chǎn)物
  • 用于醫(yī)學(xué)目的的基因分析
  • 在物種或后代之間比較DNA
  • 分析物種之間的進(jìn)化和分類學(xué)關(guān)系
  • 了解限制酶在哪里切割DNA的不同部分
  • 親子鑒定
  • 測(cè)試抗生素耐藥性